La sélection animale est l'éléments fondamental qui régit la production dans un élevage.
Sélectionner les animaux consiste à repérer les meilleurs géniteurs mâles et femelles pour des critères donnés et de les mettre à la reproduction pour obtenir des descendants qui sont porteurs des critères recherchés.
Les méthodes de sélection ont évolué dans le temps.
Le choix sur ascendance consiste à repérer les géniteurs pressentis comme étant "améliorateurs" et à les accoupler entre eux. Cette méthode manque de fiabilité surtout en considérant que par les lois de la génétique la transmission d'un caractère à la descendance n'est pas assurée.
L'apparition de la congélation de la semence à permis des avancées significatives puisqu'elle consiste à faire produire de la semence à un géniteur mâle, à la stocker pendant un certain nombre d'années pendant lesquelles on contrôle un échantillon de ses descendants (testage sur descendance). Ce n'est que lorsque la certitude est obtenue de la transmission la plus fréquente possible des caractères recherchés que la semence congelée est mise en service.
Depuis quelques années une nouvelle technique de sélection est apparue qui consiste par la cartographie du génome et à rechercher des marqueurs associés à la présence de tel ou tel caractère désirable ou indésirable : Il s'agit de la sélection génomique.
Cette technique devrait améliorer sensiblement les chances de détection des géniteurs et permettra d'alléger les opérations de testage sur descendance.